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CVE-2026-31965

CVE-2026-31965 · HTSlib CRAM reader has out-of-bounds reads due to improper validation of input

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HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data. In the `cram_decode_slice()` function called while reading CRAM records, validation of the reference id field occurred too late, allowing two out of bounds reads to occur before the invalid data was detected. The bug does allow two values to be leaked to the caller, however as the function reports an error it may be difficult to exploit them. It is also possible that the program will crash due to trying to access invalid memory. Versions 1.23.1, 1.22.2 and 1.21.1 include fixes for this issue. There is no workaround for this issue.

CVSS 6.9 · Media · EPSS 0,4% · Corrección disponible

Publicación
Actualización

Pila tecnológica: system

Productos y versiones afectados

  • htslib

    Versiones
    • < 1.21.1: Afectada
    • >= 1.22, < 1.22.2: Afectada
    • = 1.23: Afectada

    Sin corrección publicada

  • htslib Debian:12

    Versiones
    • 1.16+ds-3
    • 1.17+ds-0+exp1
    • 1.17+ds-1
    • 1.18+ds-0+exp1
    • 1.18+ds-1
    • 1.19+ds-0+exp0
    • 1.19+ds-1
    • 1.19+ds-1+exp1
    • 1.19+ds-1.1
    • 1.20+ds-1
    • 1.20+ds-2
    • 1.21+ds-0+exp1
    • 1.21+ds-0+exp2
    • 1.21+ds-1
    • 1.22.1+ds-1
    • 1.22.1+ds-2
    • 1.22.1+ds2-1
    • 1.24-1
    • 1.24-2
    • 1.24-3
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Debian:13

    Versiones
    • 1.21+ds-1
    • 1.22.1+ds-1
    • 1.22.1+ds-2
    • 1.22.1+ds2-1
    • 1.24-1
    • 1.24-2
    • 1.24-3
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Debian:14

    Versiones
    • 1.21+ds-1
    • 1.22.1+ds-1
    • 1.22.1+ds-2
    • 1.22.1+ds2-1
    • 1.24-1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: < 1.24-2

    Actualiza a 1.24-2

  • htslib Ubuntu:Pro:14.04:LTS

    Versiones
    • 0.2.0~rc3-1
    • 0.2.0~rc3-1ubuntu0.1~esm1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Ubuntu:Pro:16.04:LTS

    Versiones
    • 1.2.1-1
    • 1.2.1-2
    • 1.2.1-2ubuntu1
    • 1.2.1-2ubuntu1+esm1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Ubuntu:Pro:18.04:LTS

    Versiones
    • 1.5-1
    • 1.5-4ubuntu1
    • 1.6-3ubuntu1
    • 1.6-4
    • 1.6-4build1
    • 1.7-2
    • 1.7-2ubuntu0.1~esm1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Ubuntu:20.04:LTS

    Versiones
    • 1.9-10
    • 1.9-11
    • 1.9-12
    • 1.10.2-2ubuntu1
    • 1.10.2-2ubuntu2
    • 1.10.2-3
    • 1.10.2-3ubuntu0.1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Ubuntu:22.04:LTS

    Versiones
    • 1.13+ds-2
    • 1.13+ds-2build1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Ubuntu:24.04:LTS

    Versiones
    • 1.17+ds-1
    • 1.18+ds-1
    • 1.19+ds-1.1build2
    • 1.19+ds-1.1build3
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Ubuntu:25.10

    Versiones
    • 1.21+ds-1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Ubuntu:26.10

    Versiones
    • 1.22.1+ds2-1
    • 1.22.1+ds2-1build1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

  • htslib Ubuntu:26.04:LTS

    Versiones
    • 1.21+ds-1
    • 1.22.1+ds2-1
    Intervalos de versiones afectados
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Sin corrección publicada

Fuentes originales

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