CVE-2026-116742
CVE-2026-116742 · HTSlib through 1.24 Heap Out-of-Bounds Write via Truncated .gzi Index Count
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HTSlib through 1.24 contains a heap out-of-bounds write and read vulnerability in bgzf_index_load_hfile() in bgzf.c that allows attackers to corrupt heap memory by supplying a crafted .gzi index entry count. A count of 0xFFFFFFFF truncates noffs to zero, causing writes past a malloc(0) buffer and an offs[-1] read in bgzf_useek(), resulting in heap corruption or crashes in tools like samtools and bcftools.
CVSS 4.8 · Moyenne · EPSS 0,1%
- Publication
- Mise à jour
Pile logicielle: system
Produits et versions concernés
htslib
- Versions du logiciel
- ≥ 0, ≤ 1.24: Concernée (custom)
Aucun correctif publié
htslib Debian:12
- Versions du logiciel
- 1.16+ds-3
- 1.17+ds-0+exp1
- 1.17+ds-1
- 1.18+ds-0+exp1
- 1.18+ds-1
- 1.19+ds-0+exp0
- 1.19+ds-1
- 1.19+ds-1+exp1
- 1.19+ds-1.1
- 1.20+ds-1
- 1.20+ds-2
- 1.21+ds-0+exp1
- 1.21+ds-0+exp2
- 1.21+ds-1
- 1.22.1+ds-1
- 1.22.1+ds-2
- 1.22.1+ds2-1
- 1.24-1
- 1.24-2
- 1.24-3
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Debian:13
- Versions du logiciel
- 1.21+ds-1
- 1.22.1+ds-1
- 1.22.1+ds-2
- 1.22.1+ds2-1
- 1.24-1
- 1.24-2
- 1.24-3
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Debian:14
- Versions du logiciel
- 1.21+ds-1
- 1.22.1+ds-1
- 1.22.1+ds-2
- 1.22.1+ds2-1
- 1.24-1
- 1.24-2
- 1.24-3
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Ubuntu:Pro:14.04:LTS
- Versions du logiciel
- 0.2.0~rc3-1
- 0.2.0~rc3-1ubuntu0.1~esm1
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Ubuntu:Pro:16.04:LTS
- Versions du logiciel
- 1.2.1-1
- 1.2.1-2
- 1.2.1-2ubuntu1
- 1.2.1-2ubuntu1+esm1
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Ubuntu:Pro:18.04:LTS
- Versions du logiciel
- 1.5-1
- 1.5-4ubuntu1
- 1.6-3ubuntu1
- 1.6-4
- 1.6-4build1
- 1.7-2
- 1.7-2ubuntu0.1~esm1
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Ubuntu:20.04:LTS
- Versions du logiciel
- 1.9-10
- 1.9-11
- 1.9-12
- 1.10.2-2ubuntu1
- 1.10.2-2ubuntu2
- 1.10.2-3
- 1.10.2-3ubuntu0.1
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Ubuntu:22.04:LTS
- Versions du logiciel
- 1.13+ds-2
- 1.13+ds-2build1
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Ubuntu:24.04:LTS
- Versions du logiciel
- 1.17+ds-1
- 1.18+ds-1
- 1.19+ds-1.1build2
- 1.19+ds-1.1build3
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Ubuntu:26.10
- Versions du logiciel
- 1.22.1+ds2-1
- 1.22.1+ds2-1build1
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
htslib Ubuntu:26.04:LTS
- Versions du logiciel
- 1.21+ds-1
- 1.22.1+ds2-1
- Plages de versions concernées
- ECOSYSTEM: (−∞, +∞)
Aucun correctif publié
Sources originales
- https://github.com/samtools/htslib/pull/2057
- https://github.com/samtools/htslib/commit/18dddf02bb2c0053b32acec427723555a24b2873
- https://github.com/samtools/htslib
- https://github.com/samtools/htslib/blob/1.24/bgzf.c#L2504
- https://hackmd.io/@haindpwn/htslib-bgzf-gzi-int-truncation-oob
- https://github.com/samtools/htslib/issues/2113
- https://www.vulncheck.com/advisories/htslib-through-1.24-heap-out-of-bounds-write-via-truncated-gzi-index-count
- https://nvd.nist.gov/vuln/detail/CVE-2026-116742