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CVE-2026-31969

CVE-2026-31969 · HTSlib CRAM decoder has a heap buffer overflow

Cette page présente des faits issus de sources publiques. Consultez l’avis original avant toute mise à jour.

HTSlib is a library for reading and writing bioinformatics file formats. CRAM is a compressed format which stores DNA sequence alignment data using a variety of encodings and compression methods. When reading data encoded using the `BYTE_ARRAY_STOP` method, an out-by-one error in the `cram_byte_array_stop_decode_char()` function check for a full output buffer could result in a single attacker-controlled byte being written beyond the end of a heap allocation. Exploiting this bug causes a heap buffer overflow. If a user opens a file crafted to exploit this issue, it could lead to the program crashing, or overwriting of data and heap structures in ways not expected by the program. It may be possible to use this to obtain arbitrary code execution. Versions 1.23.1, 1.22.2 and 1.21.1 include fixes for this issue. There is no workaround for this issue.

CVSS 7.1 · Élevée · EPSS 0,3% · Correctif disponible

Publication
Mise à jour

Pile logicielle: system

Produits et versions concernés

  • htslib

    Versions du logiciel
    • < 1.21.1: Concernée
    • >= 1.22, < 1.22.2: Concernée
    • = 1.23: Concernée

    Aucun correctif publié

  • htslib Debian:12

    Versions du logiciel
    • 1.16+ds-3
    • 1.17+ds-0+exp1
    • 1.17+ds-1
    • 1.18+ds-0+exp1
    • 1.18+ds-1
    • 1.19+ds-0+exp0
    • 1.19+ds-1
    • 1.19+ds-1+exp1
    • 1.19+ds-1.1
    • 1.20+ds-1
    • 1.20+ds-2
    • 1.21+ds-0+exp1
    • 1.21+ds-0+exp2
    • 1.21+ds-1
    • 1.22.1+ds-1
    • 1.22.1+ds-2
    • 1.22.1+ds2-1
    • 1.24-1
    • 1.24-2
    • 1.24-3
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Debian:13

    Versions du logiciel
    • 1.21+ds-1
    • 1.22.1+ds-1
    • 1.22.1+ds-2
    • 1.22.1+ds2-1
    • 1.24-1
    • 1.24-2
    • 1.24-3
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Debian:14

    Versions du logiciel
    • 1.21+ds-1
    • 1.22.1+ds-1
    • 1.22.1+ds-2
    • 1.22.1+ds2-1
    • 1.24-1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: < 1.24-2

    Mettez à jour vers 1.24-2

  • htslib Ubuntu:Pro:14.04:LTS

    Versions du logiciel
    • 0.2.0~rc3-1
    • 0.2.0~rc3-1ubuntu0.1~esm1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Ubuntu:Pro:16.04:LTS

    Versions du logiciel
    • 1.2.1-1
    • 1.2.1-2
    • 1.2.1-2ubuntu1
    • 1.2.1-2ubuntu1+esm1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Ubuntu:Pro:18.04:LTS

    Versions du logiciel
    • 1.5-1
    • 1.5-4ubuntu1
    • 1.6-3ubuntu1
    • 1.6-4
    • 1.6-4build1
    • 1.7-2
    • 1.7-2ubuntu0.1~esm1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Ubuntu:20.04:LTS

    Versions du logiciel
    • 1.9-10
    • 1.9-11
    • 1.9-12
    • 1.10.2-2ubuntu1
    • 1.10.2-2ubuntu2
    • 1.10.2-3
    • 1.10.2-3ubuntu0.1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Ubuntu:22.04:LTS

    Versions du logiciel
    • 1.13+ds-2
    • 1.13+ds-2build1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Ubuntu:24.04:LTS

    Versions du logiciel
    • 1.17+ds-1
    • 1.18+ds-1
    • 1.19+ds-1.1build2
    • 1.19+ds-1.1build3
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Ubuntu:25.10

    Versions du logiciel
    • 1.21+ds-1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Ubuntu:26.10

    Versions du logiciel
    • 1.22.1+ds2-1
    • 1.22.1+ds2-1build1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

  • htslib Ubuntu:26.04:LTS

    Versions du logiciel
    • 1.21+ds-1
    • 1.22.1+ds2-1
    Plages de versions concernées
    • ECOSYSTEM: (−∞, +∞)

    Aucun correctif publié

Sources originales

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